細菌・古細菌以外の生物由来のデータを除外（SILVAデータベース）

近年のSILVAでは、Chloroplast（葉緑体）、Mitochondria（ミトコンドリア）、Eukaryota（真核生物）と同定されて出てくる配列があるので、Rでそれらをはじくコードをメモ。

dataには、行にASV（OTU）、列にサンプル＋分類群（Kingdom, Phylum, ...）が入った"カウント＋分類群"のデータを用いる。

data2 <- data %>%
  dplyr::filter(Order != "Chloroplast" | is.na(Order)) %>%
  dplyr::filter(Family != "Mitochondria" | is.na(Family)) %>%
  dplyr::filter(Kingdom != "Eukaryota" | is.na(Kingdom))

参考サイト：龍見史恵さんのGitHub (https://github.com/Chikae-Tatsumi/NGS-Data-Processing/blob/master/dada2_16S_IonTorrent.r )