2023年8月7日FUNGuildのエラー"UnicodeEncodeError: 'cp932' codec can't encode character~"の対処法真菌の系統情報から、そのギルド(例:Saprotroph/腐生菌)を調べるのに便利なツールFUNGuildがある。 参考:https://github.com/UMNFuN/FUNGuild 詳細な使い方は今回は割愛するとして、出たエラーとその対処法について書く。...
2022年9月11日NGSで得た配列が対象の生物由来かをざっくりと確認細菌の16S rRNA配列や真菌のITS配列のように、配列を既知のものと照合するデータベース(greengenes, Silva, UNITEなど)が充実しているものは、確認しなくてもいいかもしれない。 しかし、例えば特定の酵素を持つ微生物種の群集構造を調べるために、その酵...