先日、投稿した論文の査読者に、図のマイナスがハイフンだと指摘された。 デフォルトでの軸はこんな感じ↓ いやRでデフォルトでこうなってるのにそこ修正する？という感じだが、ハイフンであるのは間違いないので、修正することにした。 以下、当時のツイート...

他の人に役に立つかわからないけど、自分はよく使うコードをメモ。 変数名は適宜変更してください。 ・数値が文字列として認識されてしまったときに、数値型に戻す num <- as.numeric(as.character(as.factor(nm)))...

デフォルトのmerge関数では、2つのデータフレームまでしか結合できないので、3つ以上のデータフレームを結合する関数を定義する。 参考サイト：http://aoki2.si.gunma-u.ac.jp/lecture/mb-arc/arc040/03212.html...

近年のSILVAでは、Chloroplast（葉緑体）、Mitochondria（ミトコンドリア）、Eukaryota（真核生物）と同定されて出てくる配列があるので、Rでそれらをはじくコードをメモ。 dataには、行にASV（OTU）、列にサンプル＋分類群（Kingdom,...